Akcja filmu dzieje się kilka lat po wydarzeniach z poprzedniej części. Albus Dumbledore wiedząc, że demoniczny Gellert Grindelwald pragnie zawładnąć światem magii, zleca Newtowi stworzenie armii, która będzie mogła pokonać oddziały czarnoksiężnika. Sytuacja sprawi, że Dumbledore w końcu będzie musiał przestać obserwować wszystko z boku.